Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms