Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
APOBEC1P41238 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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