Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms