Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms