Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms