Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRCP08575 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms