Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9Y3F1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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