Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms