Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms