Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL42Q9P2K6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms