Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms