Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNGAP1Q96PV0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms