Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COG3Q96JB2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG3Q96JB2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms