Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PHF3Q92576 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PHF3Q92576 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHF3Q92576 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PHF3Q92576 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PHF3Q92576 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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