Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS8Q8N3P4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS8Q8N3P4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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