Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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