Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EEA1Q15075 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms