Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNB1Q14721 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms