Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MKRN3Q13064 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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