Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms