Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms