Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP4AP20648 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms