Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2A2P16615 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms