Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP2AP11388 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP2AP11388 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms