Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms