Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPLO60437 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPLO60437 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPLO60437 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms