Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBDO15205 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBDO15205 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms