Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF25A6NGN4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PRAMEF25A6NGN4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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