Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNA3Q9UI47 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms