Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP35Q9P2H5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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