Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIPA1L2Q9P2F8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms