Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHRF1Q9P1Y6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHRF1Q9P1Y6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms