Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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