Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FBXO28Q9NVF7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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