Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRDE2Q9H7Z3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms