Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP181-201ENST00000411188 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL109754.1-201ENST00000449270 1036 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FANCD2OS-204ENST00000450660 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL161785.1-201ENST00000455981 583 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DCTN6-203ENST00000520829 880 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC079322.1-201ENST00000568345 1135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL844908.1-201ENST00000609953 652 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HNRNPCL2-202ENST00000621994 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms