Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFJQ9BTM1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms