Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERPUD2Q9BSE4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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