Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms