Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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UBE2E3Q969T4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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UBE2E3Q969T4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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UBE2E3Q969T4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBE2E3Q969T4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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