Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF4BQ92750 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms