Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms