Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms