Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms