Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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