Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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UBE3CQ15386 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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UBE3CQ15386 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
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UBE3CQ15386 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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UBE3CQ15386 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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UBE3CQ15386 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3CQ15386 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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