Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARHGEF6Q15052 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms