Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD6Q15008 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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