Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms