Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms